با وجود فرصت‌های بی‌شمار، استفاده از بازاریابی دیجیتال همراه با چالش‌هایی نیز است که موسسات مهاجرتی باید برای مقابله با آن‌ها راهکارهای مناسبی اتخاذ کنند. تغییرات مداوم در الگوریتم‌های موتورهای جستجو، نیاز به بروز رسانی مداوم محتوا و افزایش رقابت میان سایت‌های مشابه از مهم‌ترین چالش‌ها به شمار می‌روند. همچنین، waiting for link from Web 2.0 Blogs (98)